由刘玉华教授创立，现由李辉教授主持，系国内较早成立的斜视弱视专业组，在斜视弱视临床诊疗、甲状腺相关性眼病诊治方面在国内居领先地位，每年接诊大量全国各地初诊和转诊而来的患者。自眼肌屈光专业组成立以来，对儿童斜弱视及青少年近视进行了长期深入的临床研究。挽救了数以万计儿童的视力和立体视。此项研究曾获得北京市科技进步奖。我院非常重视斜视术前的准确检查和手术的合理设计。术者技术娴熟，富有经验，成功率高。其中《儿童疑难垂直斜视的手术治疗》曾获年医疗成果奖。
近20年来对跨学科的疑难疾病--甲状腺相关性眼病的临床研究取得突破性进展，与内分泌科、放疗科、核医学科合作治疗此病，并进行临床和基础方面研究，在诊疗方面处国内领先水平，使患者得到及时恰当治疗，疗效显著。根据疾病的分期、分型采用不同治疗方案，提高了疗效，减少了治疗的并发症。目前在国家十一五课题基金的资助下，开展斜视及屈光方面的临床与基础研究。