9月18日，我中心为第一署名单位，谢志教授为最后通讯作者的文章“MECAT: fast mapping, error correction, and de novo assembly for single-molecule sequencing reads”在Nature Methods杂志发表（影响因子：25.062）。Nature Methods杂志是Nature的子刊，杂志主要提供在生命科学领域的新方法和经过验证的基础研究技术的重大进展。
以PacBio单分子实时和Oxford Nanopore纳米孔为代表的三代测序平台，产生的测序读长目前主流的二代测序100倍以上，很好的解决复杂基因组的组装及结构变异等难题，为基因测序和精准医学领域带来了全新的机遇。然而三代测序数据的高错误率（12-15%）给数据分析带来巨大的挑战，严重影响了三代测序技术的应用。为此，谢志教授团队提出了一种全新的基于全局投票打分的候选序列评估方法，该方法可以大幅降低三代序列比对、校正和组装的计算资源消耗，从而极大提高计算效率；并基于此方法成功开发了集序列比对、校正和组装为一体的三代测序分析软件MECAT。与同类软件相比，MECAT在计算速度上表现出了明显的优势，在人类基因组的组装速度是同类软件的17-23倍，并且首次在单个服务器上用7天左右实现了人类的基因组组装工作；为加速三代测序技术在生物和医学的应用提供了重要的支撑。
文章链接：
http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.4432.html?foxtrotcallback=true#affil-auth